OberonCore
https://forum.oberoncore.ru/

Oberon под Linux на кластере
https://forum.oberoncore.ru/viewtopic.php?f=30&t=1686
Страница 2 из 2

Автор:  Иван Денисов [ Четверг, 08 Ноябрь, 2018 04:33 ]
Заголовок сообщения:  Re: Oberon под Linux на кластере

Искал свои старые заметки про кластер и нашел эту тему. Подумал, что эта тема "в тему", поэтому выкладываю инструкции тут.

Чтобы запустить Блэкбокс на кластере, я использовал следующую систему:

1. В директорию /home/denisov/lib32 я положил необходимые библиотеки от Ubuntu 32-bit. На кластере стоит RedHat, а это тоже Linux, поэтому они оказались вполне совместимы.

2. В директорию /home/denisov/mpich32 я положил необходимые библиотеки для MPI, которые были собраны для 32битной системы.

3. В директории /home/denisov/mpich скомпилированная из исходников mpich-3.1.4 для системы RedHat.
Код:
./configure --prefix=/home/denisov/mpich --disable-fortran
make
make install


И потом я запускаю следующим скриптом:

Код:
#!/bin/sh

rn=`readlink -f "${0}"`
pd=`dirname "${rn}"`
sd=`readlink -f .`

PATH=/home/denisov/mpich/bin:$PATH; export PATH
LD_LIBRARY_PATH=/home/denisov/mpich32/lib:/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH; export LD_LIBRARY_PATH

env \
BB_PRIMARY_DIR="${pd}" \
BB_SECONDARY_DIR="${sd}" \
BB_PACKED_NAME="${lib}" \
mpiexec -n 4 /home/denisov/lib32/ld-linux.so.2 --library-path /home/denisov/lib32:$LD_LIBRARY_PATH ./blackbox


Директории lib32, mpich32 и mpich выложил тут:

http://pub.iadenisov.ru/soft/blackbox/

Вложение:
2018-11-08_08-31-30.png
2018-11-08_08-31-30.png [ 63.14 КБ | Просмотров: 502 ]

Автор:  Борис Рюмшин [ Четверг, 08 Ноябрь, 2018 09:57 ]
Заголовок сообщения:  Re: Oberon под Linux на кластере

/home/denisov на NFS между узлами?

Автор:  Иван Денисов [ Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:01 ]
Заголовок сообщения:  Re: Oberon под Linux на кластере

Борис Рюмшин писал(а):
/home/denisov на NFS между узлами?

Просто рабочая директория на узле... думаю, что NFS нет кроме подключения к общей внешней "хранилке".

Автор:  Борис Рюмшин [ Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:05 ]
Заголовок сообщения:  Re: Oberon под Linux на кластере

Не, ну выполнимая то часть должна же на каждом узле кластера оказаться каким-то образом. Если кластер типовой архитектуры (Beowulf), например. Ну то есть домашний каталог один и тот же на всех узлах кластера.

Автор:  Борис Рюмшин [ Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:08 ]
Заголовок сообщения:  Re: Oberon под Linux на кластере

А, ну там headnode как раз, остальные с него и цепляют каталог скорее всего. Вопрос скорее уточняющий был)

Страница 2 из 2 Часовой пояс: UTC + 3 часа
Powered by phpBB® Forum Software © phpBB Group
https://www.phpbb.com/