OberonCore

Библиотека  Wiki  Форум  BlackBox  Компоненты  Проекты
Текущее время: Пятница, 16 Ноябрь, 2018 10:22

Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 25 ]  На страницу Пред.  1, 2
Автор Сообщение
 Заголовок сообщения: Re: Oberon под Linux на кластере
СообщениеДобавлено: Четверг, 08 Ноябрь, 2018 04:33 
Аватара пользователя

Зарегистрирован: Четверг, 08 Октябрь, 2009 15:00
Сообщения: 2208
Искал свои старые заметки про кластер и нашел эту тему. Подумал, что эта тема "в тему", поэтому выкладываю инструкции тут.

Чтобы запустить Блэкбокс на кластере, я использовал следующую систему:

1. В директорию /home/denisov/lib32 я положил необходимые библиотеки от Ubuntu 32-bit. На кластере стоит RedHat, а это тоже Linux, поэтому они оказались вполне совместимы.

2. В директорию /home/denisov/mpich32 я положил необходимые библиотеки для MPI, которые были собраны для 32битной системы.

3. В директории /home/denisov/mpich скомпилированная из исходников mpich-3.1.4 для системы RedHat.
Код:
./configure --prefix=/home/denisov/mpich --disable-fortran
make
make install


И потом я запускаю следующим скриптом:

Код:
#!/bin/sh

rn=`readlink -f "${0}"`
pd=`dirname "${rn}"`
sd=`readlink -f .`

PATH=/home/denisov/mpich/bin:$PATH; export PATH
LD_LIBRARY_PATH=/home/denisov/mpich32/lib:/usr/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH; export LD_LIBRARY_PATH

env \
BB_PRIMARY_DIR="${pd}" \
BB_SECONDARY_DIR="${sd}" \
BB_PACKED_NAME="${lib}" \
mpiexec -n 4 /home/denisov/lib32/ld-linux.so.2 --library-path /home/denisov/lib32:$LD_LIBRARY_PATH ./blackbox


Директории lib32, mpich32 и mpich выложил тут:

http://pub.iadenisov.ru/soft/blackbox/

Вложение:
2018-11-08_08-31-30.png
2018-11-08_08-31-30.png [ 63.14 КБ | Просмотров: 130 ]


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Oberon под Linux на кластере
СообщениеДобавлено: Четверг, 08 Ноябрь, 2018 09:57 
Администратор

Зарегистрирован: Вторник, 15 Ноябрь, 2005 01:14
Сообщения: 4133
Откуда: Россия, Орёл
/home/denisov на NFS между узлами?


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Oberon под Linux на кластере
СообщениеДобавлено: Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:01 
Аватара пользователя

Зарегистрирован: Четверг, 08 Октябрь, 2009 15:00
Сообщения: 2208
Борис Рюмшин писал(а):
/home/denisov на NFS между узлами?

Просто рабочая директория на узле... думаю, что NFS нет кроме подключения к общей внешней "хранилке".


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Oberon под Linux на кластере
СообщениеДобавлено: Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:05 
Администратор

Зарегистрирован: Вторник, 15 Ноябрь, 2005 01:14
Сообщения: 4133
Откуда: Россия, Орёл
Не, ну выполнимая то часть должна же на каждом узле кластера оказаться каким-то образом. Если кластер типовой архитектуры (Beowulf), например. Ну то есть домашний каталог один и тот же на всех узлах кластера.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: Oberon под Linux на кластере
СообщениеДобавлено: Четверг, 08 Ноябрь, 2018 19:08 
Администратор

Зарегистрирован: Вторник, 15 Ноябрь, 2005 01:14
Сообщения: 4133
Откуда: Россия, Орёл
А, ну там hednode как раз, остальные с него и цепляют каталог скорее всего. Вопрос скорее уточняющий был)


Вернуться к началу
 Профиль  
 
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 25 ]  На страницу Пред.  1, 2

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 1


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Вся информация, размещаемая участниками на конференции (тексты сообщений, вложения и пр.) © 2005-2018, участники конференции «OberonCore», если специально не оговорено иное.
Администрация не несет ответственности за мнения, стиль и достоверность высказываний участников, равно как и за безопасность материалов, предоставляемых участниками во вложениях.
Без разрешения участников и ссылки на конференцию «OberonCore» любое воспроизведение и/или копирование высказываний полностью и/или по частям запрещено.
Powered by phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB